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生命科学代表着现代科技的未来,G-LIMS是
由复日科技依靠其雄厚的软件开发力量 及计算机
系统集成经验, 针对大规模基因测序研究而设计
的—套完整的生物实验信息系统 。该系统的运行 |
可贯穿质粒抽提、PCR 反应、测序、 数据分析等整个基因开发研
究过程 。系统以计算机网络为基础,并可充分结合和联接基因科
研中的各种仪器设备及计算机软硬件 、如:PE377 自动测序仪、
复日 FR-980电泳图像分析系统等 。系统采用先进的
Intranet结
构,使其软件可成功跨越 PC、Mscitosh、 Sun、 SGI等多种计算
机平台,并可接人Internet以充分利用更多的外部资源。 系统从
功能上大体可以分为 :
基因科研数据模块 (Gene Research
Data System)
管理调度信息模块 (Management
Information System)
公告板模块 (Message System)
公共信息服务模块 (Public
lnformation Service)
基因数据库数据交换模块 (Gene
Database Exchange)

G-LIMS的主要功能
 建立克隆管理数据库,从质粒抽提、
PCR反应、测序、到数
据分跟踪整个实验过程, 统—存储和管理其间所产生的大量实验
数据 。
 系统可自动或协助用户生成反应上样计划。
 系统可以与 ABI PRISM互相交互传送数据。在测序前自动生成
Sample Sheet,测序后导出测序结果表。
 系统可解决一次反应96个样品和—次测序不足96个样品所引起
的上样个数不相等的麻烦。
 系统可对已完成的测序或反应实验结果进行统计,查找出失败
样品的测序和相关反应信息,协助分析失败原因, 制订重测计
划。
 系统可管理由GDS(如:复日FR—980或其它产品)所拍摄的质粒
的电泳凝胶图像。
 系统可对引物的设计、合成、接收进行有效的管理。
 所有实验数据相互关联,系统自动建立和更新基因实验状况汇
总表,跟踪反映整个科研工程进展。
 系统提供完善的基因数据查询管理工具,更可作为基因数据库
的有效查询入口。
 系统提供一组图形化的序列分析工具,如:读框显示、启始码
/结束码识别、翻译蛋白质序列等。
 系统可配合大量的第三方基因分析软件资源(如:GCG、NCBI等),
定制接收和导出各种格式的文件报告。
 配合科研,对整个机构的项目经费、人员、仪器设备、实验消
耗品、专利申报等进行统一管理。
 系统提供了可跨越平台的电子公告板系统,以协调各工作组用
户之间的工作。方便相互交换信息。
 系统通过公共信息服务模块与外部网络连接。以
Web方式通过
Internet向公众发布消息, 建立永久可供外界访问的公共信息
服务站点,以充分利用本单位的信息和计算资源。

G-LIMS的主要特点

 采用 SQL服务器结构建立LIMS数据库,更易扩展和与外部数据
库进行数据交换。
 用户权限按工作组进行管理,系统设计高度强调网络安全性和
数据的保密性。
 系统大量支持Internet/Intranet资源。如:FTP、HTTP等。建
立在 Web上的应用程序可方便跨越
Sun、Mac、PC等多种计算机
平台。
 用户可随时随地通过本系统动态获得整个工程的各项科研数据
及信息。且LIMS可与基因数据库构成关联。
 系统可充分结合现有的实际设备,做到对仪器设备和计算机网
络资源的最大利用率。
 系统对PC或各种UNIX机器都有比较好的支持,具有Windows95
/NTClient和Web Client二种用户端程序。
 系统可对大量(超过数百G 的)基因数据进行灵活、安全的成批
转移和备份,并可对存储于其他介质(光盘、磁带、MO等)上的
数据进行方便地查询。
G-LIMS的系统结构
连接到G-LIMS的系统结构图 |